ЛЕНТА

Еще одно антитело к старому коронавирусу нейтрализовало новый

Pinto et al., / Nature, 2020

В крови пациента, переболевшего в 2003 году пневмонией, вызванной SARS-CoV, нашли антитела, способные нейтрализовать SARS-CoV-2. Они узнают участок S-белка, консервативный для обоих вирусов, связываются с ним и мешают проникнуть в клетку. Ученые надеются, что использование таких антител в лечении и профилактике помешает вирусам выработать устойчивость, которая может появиться при терапии более узкоспецифичными антителами. Работа опубликована в журнале Nature.

Для эффективного лечения антителами важно выбрать для них правильную мишень, с которой они будут связываться. Это должен быть какой-то важный для вируса участок, расположенный на его поверхности. В случае с SARS-CoV-2 многие исследователи сконцентрировались на поиске антител, узнающих RBD-домен его S-белка. Он отвечает этим требованиям, — расположен в относительно доступном для антител месте и играет ключевую роль при заражении: если его «прикрыть» антителом, то вирус не сможет прицепиться к человеческим клеткам и перестанет быть опасным.

При этом такой выбор сопряжен с возможными проблемами. Известно, что на протяжении своей длины этот участок по-разному консервативен: там есть как последовательности, уникальные для SARS-CoV-2, так и более универсальные, которые похожи внутри родственной группы штаммов, к которым относятся SARS-CoV-2 и сам SARS. Учитывая «любовь» коронавирусов к рекомбинации — обмену участками генома между штаммами — имеет смысл искать антитела, узнающие консервативные участки, — так меньше шансов появления устойчивых мутантных версий вирусов, а заодно эти же антитела могут быть полезны при другой коронавирусной инфекции. Дополнительно использование RBD-домена в качестве мишени для антитела осложняет то, что в некоторых конформациях S-белок может его прятать и делать недоступным для антител.

Чтобы найти антитела широкого спектра Дора Пинто (Dora Pinto) и ее коллеги из швейцарской компании Humabs Biomed SA проверили на эффективность против SARS-CoV-2 антитела из образцов крови пациента, переболевшего атипичной пневмонией в 2003 году. Из 25 протестированных антител восемь оказались способны связываться с S-белком SARS-CoV-2, а одно антитело (S309) оказалось особенно перспективным. S309 оказалось способно не только связываться с S-белком, но вдобавок нейтрализовало SARS-CoV-2 и его безопасный аналог (псевдовирус), на котором проверяют его способность проникать в клетки.

При помощи криоэлектронной микроскопии исследователи выяснили как именно взаимодействуют антитело и S-белок. Оказалось, что антитело связывается не с RBD-доменом, а с близлежащим участком длиной 22 аминокислоты. Этот участок оказался консервативен как среди изолятов непосредственно SARS-CoV-2, так и у других штаммов коронавирусов той же группы, например у RaTG-13 и SARS-CoV. Предыдущее исследование показало, что комплекс S-белков может находиться в закрытой и открытой конформации, и S309 успешно связывается с обоими вариантами.

Судя по 3D-структуре, антитело не конкурирует напрямую с рецептором ACE2, закрывая ему доступ к RBD-домену, так что механизм, по которому это антитело нейтрализует вирус, требует дополнительных исследований. Исследователи продемонстрировали что S309 хорошо взаимодействует с Fc-рецепторами клеток врожденного иммунитета и способно активировать их. Чтобы однозначно нейтрализовать вирус исследователи предлагают использовать в дальнейшем их антитела в комбинации с другими. По аналогии с комбинациями антибиотиков такие смеси из антител должны лучше работать и не позволят ускользнуть и размножиться мутантным вирусам, которые перестали узнаваться каким-то одним антителом.

Это не первые антитела к SARS, которые оказались потенциально полезны при новой пандемии. До этого мы рассказывали про похожее антитело 47D11, которое обнаружили голландские исследователи.

Вера Мухина

источник

Похожие статьи

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Кнопка «Наверх»
Do NOT follow this link or you will be banned from the site!
Установите приложение MEGANEWS на Google Play
УСТАНОВИТЬ
Закрыть
Закрыть

Обнаружен Adblock

Поддержите нас, пожалуйста, отключив блокировку рекламы.